理想的無菌操作室應劃為三部分：

1、更衣室—―供更換衣服、鞋子及穿戴帽子和口罩。

2、 緩沖間—―位于更衣間與操作間之間，目的是為了保證操作間的無菌環境，同時可放置恒溫培養箱及某些必需的小型儀器。

3、無菌操作間—―于無菌操作、細胞培養。其大小要適當，且其頂部不宜過高（不超過2.5m）以保證紫外線的有效自凈效果；墻壁光滑*以便清潔和消毒。工作臺安置不應靠墻壁，臺面要光滑壓塑作表面，漆成白色或灰色以利于解剖組織及酚紅顯示pH的觀察。